1、 1 / 9 中文 7300 字 出处: Liu J Z, Sommeren S V, Huang H, et al. Association analyses identify 38 susceptibility loci for inflammatory bowel disease and highlight shared genetic risk across populationsJ. Nature Genetics, 2015, 47(9). 细胞与医学遗传学实验 文献翻译 文献标题 : Association analyses identify 38 susceptibility
2、loci for inflammatory bowel disease and highlight shared genetic risk across populations 来源期刊 : Nature Genetics 选课代码 : MED130062.01 姓名 : 专业 : 2013 届临床医学 学号 : 班级 : 2 / 9 关联分析确定了 38个 炎症性肠 病 的 易感基因位点 及其 在人群中的 共同遗传风险 炎症性肠 病 ( IBD) 包括 慢性、 复发性肠道炎症 。这一疾病影响了欧洲超过 250 万人的健康,并且在亚洲和发展中国家表现出不断增高的发病率。 IBD 被认为是 由
3、遗传 性 易感宿主体内的 肠道黏膜免疫系统 对于体内 共 生细菌 的异常激活 所导致的。 到目前为止, 借助 在欧洲系谱 人群 的大规模全基因关联分析 ( GWAS) , 163 个基因位点已经 被认为与 IBD 有关联 。 一些 在日本、印度和韩国进行的小规模 GWAS 分析还 在 人类白细胞抗原( HLA)区外 发现了 新的 六个显著全基因关联性。 其中的 三个位点( 13q12, FCGR2A和 SLC26A3)随后 被 在欧洲 人群中的全基因关联性所证实 。 其余三个位点 表现出相似的效果并且有力证实了之前在 欧洲 的 GWAS 分析所得的关联性 ( P 110 4) 。 包括 JAK
4、2, IL23R and NKX2-3 的一些基因位点 , 最初被认为在欧洲人群中与 IBD 有关 , 现在也被证明 在 非欧洲人群 中也会造成一定的患病风险 。 不同人群中存在 共同 的风险基因位点表明, 结合不同 系谱的人群基因型数据会有助于 额外的 IBD 相关基因位点被发现 。 这种跨系谱的关联性分析已经成功地发现了一些 其他 复杂疾病的易感基因位点 ,包括二型糖尿病和类风湿性关节炎。 在 此次研究中,我们 总共获取了 96486 个个体的全基因或者数据免疫芯片基因型数据。与我们之前发表的 GWAS 元分析 相比较,此次的研究范围增加了额外的 11535 个欧洲系谱的个体以及 9846
5、 个非欧洲系谱的个体。 利用这些数据,我们希望能找到新的 IBD 风险基因位点,并且对不同系谱人群中 IBD 易感基因的遗传结构进行比较。 结 果 研究设计 在 进行质量控制以及千人基因组归因之后(第一阶段 2012 年八月),我们共 统计了 5956例 克罗恩病 , 6968 例 溃疡性结肠炎 以及 21770 欧洲 系谱 的人口对照 组来进行 克罗恩病 、 溃疡性结肠炎 和 IBD(综合 克罗恩病 和 溃疡性结肠炎 的结果) 的 GWAS 分析 (Online Methods)。我们增加了 16619 例 克罗恩病 、 13499 例 溃疡性结肠炎 和 31766 对照人口的免疫芯片基因分型来进行重复验证。进行重复验证的人群包含了 非欧洲 系谱 的 2025 例 克罗恩病 、 2770 例 溃 3 / 9 疡性结肠炎 和 5051 对照人口 (Table 1 and Supplementary Figs. 1 and 2),所以我们使用了主成分分析来将个体分入四组中的一组(欧洲 系谱 、伊朗 系谱 、印度 系谱 和东亚 系谱 )(Supplementary Fig. 3)。 我们还使用混合线性模型( MMM)对每个组别进行了 病例对照试验 (Online Methods)。 为了将我们对欧洲